Для того, чтобы скрыть хлебные крошки от плагина YoastSEO на главной странице необходимо поместить в файл function.php следующий код:
add_filter('wpseo_breadcrumb_output', function ($output, $presentation) {
if (is_home() || is_front_page()) {
return '';
}
return $output;
}, 10, 2);